Kursus stereologi dasar: Mengukur volume dan menghitung jumlah partikel pada sediaan Histologi

Maret-April 2021

Ketika kita menghitung jumlah sel pada sediaan histologi seringkali kita langsung menghitung jumlah sel pada beberapa lapang pandang di satu irisan. Hasilnya adalah jumlah per luas tertentu sesuai dengan karakteristik irisan histologi sebagai suatu bentuk 2 dimensi. Padahal kita tahu bahwa sel dan jaringan merupakan suatu struktur 3 dimensi. Apakah hasil penghitungan dan pengukuran tersebut dapat dipercaya?

Stereologi berusaha menjawab pertanyaan tersebut dengan metode pengukuran parameter struktur 3 dimensi dari irisan mikroskopik 2 dimensi berdasarkan ilmu geometri dan statistik. 

Prinsip geometri digunakan untuk membahas tentang pengukur (probe) yang tepat untuk menghitung jumlah partikel, volume, panjang dan luas suatu struktur. Tidak semua bagian sampel yang diambil dapat diperiksa dengan mikroskop. Karena itu prinsip statistik digunakan untuk merancang pengambilan sampel jumlah subyek, blok, potongan, lapang pandang, serta melakukan kalkulasi estimasi presisi. 

Stereologi dapat diterapkan pada berbagai bidang penelitian yang melibatkan pengamatan struktur mikroskopik seperti bidang kedokteran dan ilmu kesehatan; pengembangan bahan dan obat; biologi sel, hewan dan tumbuhan dan lain lain.  Diharapkan peserta kursus mendapat gambaran tentang dasar dasar stereologi sehingga dapat membuka wawasan dan mulai menerapkan stereologi untuk mendapatkan data kuantitatif pada irisan jaringan. 

Kursus ini merupakan kursus ke-enam yang diselenggarakan di FK-KMK Universitas Gadjah Mada. Berbeda dengan kursus sebelumnya yang diselenggarakan di kelas, kursus kali ini diselenggarakan secara daring dengan menggunakan sistem manajemen pembelajaran eLOK Universitas Gadjah Mada. Penggunaan perangkat lunak FIJI, suatu program yang aksesnya dapat diperoleh secara gratis di internet untuk membantu hitung titik dan hitung partikel akan dilatihkan pada kursus kali ini. 

Materi (bahasa pengantar bahasa Indonesia)

Estimasi volume, estimasi jumlah partikel, penghitungan “coefficient of error”, dan penggunaan perangkat lunak FIJI sebagai alat bantu stereologi

Fasilitas kursus meliputi 

  1. Kuliah daring interaktif 3 kali 2,5 jam. Waktu hari Sabtu jam 09.00- 11.30 WIB
    1. 20 Maret 2021
    2. 27 Maret 2021
    3. 2 April 2021 
  2. Video, materi, referensi dan aktivitas pembelajaran terkait yang dapat dibuka peserta di luar jadwal pertemuan daring melalui sistem manajemen pembelajaran eLOK UGM.
  3. Materi praktikum yang dapat dikerjakan peserta kursus di luar pertemuan daring. Hasil praktikum peserta diunggah secara daring, diperiksa oleh instruktur dan akan dibahas pada pertemuan berikutnya. 
  4. Materi dan video di eLOK yang dapat dibuka hingga 20 Mei 2021.
  5. Sertifikat

Narasumber

  1. Rina Susilowati PhD dan Tim

Peserta

Mahasiswa, peneliti, teknisi laboratorium

Maksimal 20 orang

Biaya

Peserta dari UGM Rp. 625.000,-

Peserta Non UGM Rp. 850.000,-

Biaya ditransfer ke rekening BNI 9888807014110003 a.n UGM FKU KAF Penerimaan Seminar dan Pelatihan

Ketentuan: 

  1. Pendaftaran dapat dilakukan mengisi formulir pendaftaran http://bit.ly/Stereologi2021
  2. Pendaftaran paling lambat tanggal 18 Maret 2021
  3. Peserta terdaftar adalah peserta yang telah mengirimkan foto bukti pembayaran ke nomor WA narahubung dan telah mendapat konfirmasi sebagai peserta dari sekretariat. 
  4. Bila peserta membatalkan keikutsertaan setelah mendaftar maka peserta tidak mendapatkan pengembalian, namun dapat dialihkan ke orang lain bila kursus belum dimulai.

Spesifikasi minimum  komputer untuk praktikum dengan FIJI

Perangkat lunak dengan Intel Celeron N3350, kartu grafis Intel UHD 400, Windows 7 dengan Java3D 1.5.1 dan OpenGL 1.3

Unduh FIJI di https://imagej.net/Fiji

  1. Pilih ikon perangkat lunak yang sesuai dengan komputer/laptop anda
  2. Proses mengunduh file akan berjalan pastikan anda memiliki kuota min. 400 MB
  3. Buka folder tempat file terunduh, pilih file dengan format .zip(contoh : fiji-win64.zip), klik kanan dan pilih “Extract…”
  4. Setelah proses selesai, buka folder dan jalankan program “ImageJ-win64”

Narahubung

Satrio Adi Wicaksono

082190207845

Satrio.a.w@mail.ugm.ac.id